InnoDB bei SELECT extrem langsam

Hallo Community,

ich wende mich in meiner Verzweiflung nun an euch, denn meine Datenbank bereitet mir großes Kopfzerbechen.
Ein simpler Select wie dieser "SELECT id FROM prices WHERE product_id =12345" dauert ganze 0.1880 Sekunden, was das nutzen unserer Hauptseite beinahe unmöglich macht.

Für unser Projekt haben wir folgenden Server im Einsatz:

Typ AMD Athlon™ II X4
Anzahl CPUs Quad-Core
Taktfrequenz 4x 2,3 GHz

Hauptspeicher
Kapazität 12 GB
Typ DDR3 ECC

Festplatte/n
Anzahl 2
Kapazität 1.500 GB
Typ SATA II, 5.400upm, 8MB
RAID RAID 1 per Software

Mysql läuft hierbei mit folgender Konfiguration:

http://nopaste.me/raw/1601628034df728f2835f4.txt

Diese Konfiguration habe ich aus mehreren verschiedenen Anleitunge erstellt (In der Hoffnung, dass sich etwas bessert)
Leider hat bisher nichts geholfen.

Ein weiteres Problem ist, dass die Datenbank stark fragmentiert.

Hier ein paar Screenshots:
http://picbox.im/images/db1.png

http://picbox.im/images/db2.png


Hier noch ein Auszug aus dem MySQL Tuner Script.
http://nopaste.me/raw/17550973654df72a7182669.txt

Ich hoffe ich habe genug Informationen geliefert, wenn nicht reiche ich diese nach.

Danke im Voraus

Gruß

Florian