Netzwerkaufbau Tipp gesucht zum aufbau

Eigentlich nicht ! Der Haupttraffic passiert doch wie du schreibst zwischen Server und DBoxen.
Und eine 1 GiG Serververbindung auf einem 100 Mbit Routerport vergkümmern zu lassen ist doch Unsinn (Oder deine Beschreibung ist unverständlich)

Der Server gehört mit seinem GiG Port natürlich an einen GiG Switch der über eine GiG Port mit dem 2ten GoG Switch verbunden ist, hier an die GiG Switches sollten auch die DBoxen direkt dran, damit die jeweils direkt je eine 100 Mbit Pipe auf den Server bekommen. Schaltest du die zusammen auf einem 100er Switch müssen sich ja n mal 100 Mbit der DBoxen einen 100 Mbit Uplink teilen auf den GiG Switch...keine gutes Design ! Lässt es sich nicht anders machen aus Portmangel (du verschweigst uns ja das Wichtigste nämlich wieviel Ports deine Switches haben...) dann solltest du nicht mehr als max. 2 Dboxen auf einem 100 Mbit Switch kumulieren.
Wo der Router und die APs bzw. die WLAN attachten Notebooks rankommen spielt keine Rolle denn im Vergleich zu deren Bandbreite (WLAN max 15-20 Mbit und DSL 6 oder 12 Mbit) spielt 100 Mbit und 1 GiG keine Rolle.
Die 100er Switches sollten sternförmig an die GiG Switches gehen am besten verteilen, einer auf jeden GiG Switch. Am besten wäre es wenn du 2 oder 4 100 Mbit als Uplinks trunken (aggregieren) kannst sofern deine Switches das supporten um auch hier die Bandbreite etwas zu erhöhen... Genug Switchhardware hast du ja...